小兰拉了拉柯南的衣角，小声说：“柯南，叶才三是谁啊？他们怎么这么害怕？”柯南小声解释：“叶才三是二十年前银行抢劫案的主谋，据说被同伙杀了，现在突然出现他的名字，大家肯定会害怕。”
鲛崎岛治盯着船员手里的名单，眼神锐利：“带我去叶才三的房间！”众人也跟着站起来，纷纷表示要一起去。船员没办法，只好带着众人来到三楼的306房间，打开房门，里面果然空无一人，只有一个黑色的行李箱放在床边。
鲛崎岛治打开行李箱，里面只有几件换洗衣物和一本旧日记，日记的封面已经泛黄，第一页写着“叶才三”三个字。他快速翻了几页，里面记录的都是二十年前抢劫案的细节，还有对同伙的怨恨。“这日记是真的……”鲛崎的手微微发抖，“叶才三可能真的没死，他这次来，是为了复仇。”
服部平次凑过去看了看日记：“不对，这日记的字迹虽然模仿了叶才三的风格，但墨水是新的，应该是最近才写的。有人故意用叶才三的名字，把我们骗到船上。”柯南点点头：“而且刚才船员说叶才三是抽中的乘客，说明‘古川大’和这次旅行的主办方有关，他故意把当年的同伙和鲛崎警视都引来，肯定有目的。”
接下来的几个小时，众人各怀心事。小兰和灰原在甲板上散步，看着远处的大海，小兰担心地说：“灰原，你说会不会真的有危险？”灰原摇摇头：“别担心，有柯南、服部和夜一在，不会有事的。而且，我总觉得那个鲸井定雄有点奇怪，他刚才听到叶才三的名字时，反应太冷静了，不像其他人那么害怕。”
柯南和服部则在船上四处调查，他们发现船上的船员大多是临时招聘的，对“古川大”和叶才三的事一无所知。夜一则去找鲛崎岛治，了解当年抢劫案的更多细节。鲛崎拿出女儿的照片，声音低沉：“我女儿当年才15岁，去银行给我送便当，正好遇到抢劫，被流弹击中……我一定要找到凶手，为她报仇。”
时间慢慢过去，很快到了午夜0点。餐厅里的时钟敲响，鲛崎岛治看着时钟，叹了口气：“二十年了……抢劫案的追诉时效已经过了，我再也不能用法律制裁他们了。”他收起女儿的照片，转身准备回房间。
就在这时，上层甲板突然传来一声“砰”的巨响，像是枪声。众人立刻跑上去，只见甲板中央的旗子被烧着了，冒着黑烟，旗子下面放着一个黑色的箱子，箱子上用刀插着一张一万元的纸钞。
“是枪声！还有火光！”毛利小五郎大喊，“难道是叶才三来了？”服部平次立刻检查周围：“没有弹壳，也没有子弹孔，这声音可能不是枪声。”柯南蹲下身，看着箱子上的纸钞：“这张纸钞是旧的，上面有磨损的痕迹，而且箱子上的刀，是餐厅里的水果刀。”
夜一拿出手电筒，照向海面：“刚才听到声音时，我看到船尾有火光，可能有人在那里。”众人立刻往船尾跑，刚跑到船尾，就听到“轰隆”一声爆炸，船尾的储物间冒出大火。船员们赶紧拿来灭火器，好不容易才把火扑灭，这时大家发现，储物间里有一具被烧焦的尸体，已经看不清样貌，只能通过衣服判断是个男人。
“死人了！”矶贝渚尖叫起来，躲到一旁。鲛崎岛治皱着眉，戴上手套检查尸体：“尸体已经烧得面目全非，但手里攥着一个金属牌，上面写着‘蟹江’。”蟹江是久听到自己的名字，吓得腿软：“不……不是我！我还活着！那不是我！”
柯南和服部对视一眼，开始各自调查。柯南蹲在尸体旁，注意到尸体的手指关节有老茧，像是经常搬运东西的人；服部则在储物间外发现了一个香烟盒，里面有一根没抽完的香烟，烟头上有口红的痕迹。
“我觉得凶手是矶贝渚。”服部平次找到柯南，小声说，“烟头上有口红，船上只有她用口红，而且她当年是叶才三的情人，可能因为分赃不均杀了人。”柯南摇摇头：“不对，尸体手指上的老茧，矶贝渚作为服装店老板，不可能有这么厚的老茧。而且，爆炸是用香烟引发的，矶贝渚不抽烟，怎么会用香烟设置陷阱？”
两人各执一词，争论起来。夜一则在船尾的栏杆上发现了一个脚印，脚印的尺码很大，应该是男人的，而且脚印上有海水的痕迹，说明凶手可能从海上过来，或者去过海边。
服部平次不服气，决定自己去找证据。他想起刚才在叶才三的房间里看到的日记，觉得里面肯定有线索，便悄悄来到306房间。房间里还是和之前一样，空无一人，服部翻了翻日记，突然发现最后一页夹着一张纸条，上面写着“机房有赃款”。
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“赃款？”服部眼睛一亮，立刻往机房跑。机房里很暗，只有应急灯亮着，服部刚走进来，就听到身后有脚步声。他转身，看到一个黑影拿着铁棍朝他打来，服部来不及躲闪，被打晕在地。黑影扛起服部