晚上，众人洗漱完毕后，都聚集在柯南和夜一的房间里，讨论案情。高木拿出笔记本，说：“根据警局传来的消息，桃井、木岛、乾、猿渡、鬼贯五个人在美咲离开后的行踪已经初步调查清楚了。桃井和乾一起在河边散步，遇到了几个游客，有不在场证明；木岛一个人在山洞附近等，没有目击者；猿渡去了神社的卫生间，路上遇到了神社的工作人员，有部分不在场证明；鬼贯则说自己去了后山的桃山观景台，没有目击者。”
柯南皱起眉头：“这么说，木岛和鬼贯都没有完整的不在场证明，猿渡的不在场证明也有漏洞。美咲的死亡时间是半小时到一小时之间，他们都有作案的可能。而且美咲手里的暗号，还没和他们对应起来。”
灰原坐在一旁，喝着茶水，轻声说：“明天挖掘出第一个时光保存罐，看看里面的东西，或许就能有新的线索。现在大家也累了，早点休息，明天才有精力调查。”
众人点点头，各自回房休息。柯南躺在床上，却没有睡意。他拿出手机，看着美咲留下的暗号照片——桃子、剑、狗。如果时光保存罐的位置对应桃太郎传说的三个地点，那暗号会不会也对应传说里的三个元素，指向三个不同的线索？而凶手，就是那个线索不匹配的人。
想着想着，柯南渐渐睡着了。他做了一个梦，梦见自己在吉备津神社的后山，看到美咲和五个男人一起埋下时光保存罐，美咲手里拿着一幅画，上面画着桃太郎和三个伙伴，还有一把宝剑。突然，画面变成了美咲躺在河边的草丛里，手里攥着暗号纸，而一个戴着金丝眼镜的男人，正悄悄地把什么东西埋在樱花树下……
第二天早上，天刚亮，柯南就被手机铃声吵醒了。是高木打来的，说古松树下的时光保存罐已经挖掘出来了，让他们赶紧去吉备津神社。
众人匆匆洗漱完毕，吃了早饭，就跟着高木一起去神社。神社门口已经围了不少警员，目暮警官和佐藤也在。看到少年侦探团，目暮警官赶紧迎上来：“柯南！夜一！你们来得正好！时光保存罐已经挖出来了，里面的东西很重要！”
柯南顺着目暮警官指的方向看去，只见一个锈迹斑斑的铁盒放在一张桌子上，盒子上刻着一个小小的桃太郎图案。佐藤戴上手套，小心翼翼地打开盒子，里面的东西被一块红色的布包裹着。
打开红布，里面是六张纸条，还有一幅画。六张纸条分别是桃井、木岛、乾、猿渡、鬼贯和美咲当年写的愿望，画则是美咲画的桃太郎插画——画里的桃太郎拿着宝剑，身边跟着狗、猴子、鸡三个伙伴，背景是吉备津神社的后山。
柯南拿起纸条，一张张看了起来：
- 桃井：我想当一名历史学家，研究冈山的历史和桃太郎传说。
- 木岛：我想当一名企业家，赚很多钱，让大家都羡慕我。
- 乾：我想当一名厨师，做出全世界最好吃的鳗鱼饭。
- 猿渡：我想当一名警察，保护大家的安全。
- 鬼贯：我想当一名建筑师，设计出和桃太郎传说一样有名的建筑。
- 美咲：我想当一名画家，画出冈山所有美丽的风景，还有和大家一起的时光。
夜一看着美咲的画，说：“这幅画里的桃太郎拿着宝剑，身边有狗、猴子、鸡，和美咲留下的暗号——桃子、剑、狗对应上了！桃子代表桃太郎，剑代表宝剑，狗代表伙伴里的狗。那这三个元素，到底指向谁呢？”
柯南沉思道：“桃井的愿望是研究桃太郎传说，对应‘桃子’；鬼贯的愿望是当建筑师，需要用到‘剑’（圆规、直尺之类的工具，古代建筑师也会用剑画线）；猿渡的愿望是当警察，警察常用‘狗’来协助办案……这三个元素刚好对应桃井、鬼贯、猿渡三个人。但美咲是被勒死的，凶手用的是绳子，不是剑，这又不对。”
就在这时，一名警员跑了过来，对目暮警官说：“警官！我们在吉备津神社的拜殿附近，找到了第二个时光保存罐！埋在拜殿后面的樱花树下，上面刻着猴子的图案！”
众人立刻赶到拜殿附近。第二个时光保存罐也是铁盒，上面刻着一只猴子，和桃太郎传说里的伙伴猴子对应。佐藤打开盒子，里面同样有六张纸条，还有一个小小的木雕——是鬼贯当年做的猴子木雕，上面刻着他的名字。
纸条的内容和第一个时光保存罐里的差不多，只是多了一些对未来的期待。美咲在纸条里画了一只猴子，旁边写着：“这是给鬼贯的，因为他说要当建筑师，猴子很灵活，能帮他设计出最好的建筑。”
“猴子对应鬼贯？”柯南皱起眉头，“第一个时光保存罐里的剑对应鬼贯，第二个里的猴子也对应鬼贯，那暗号里的‘狗’对应谁呢？第三个时光保存罐应该在河边，对应‘鸡’，因为桃太郎的伙伴是狗、猴子、鸡，分别对应三个时光保存罐。”
目暮警官点点头：“现在已经找到两个时光保存罐，分别对应猴子和桃山（桃子），第三个在河边，对应鸡。我们已经派人去河边搜查了，应该很快就能找到。”