工作室里一片狼藉，书架上的书散落一地，电脑桌的抽屉被拉开，看起来像是被人翻过。柯南皱着眉头：“难道已经有人来过了？是组织的人，还是赤井秀一？”
夜一走到电脑前，检查了一下电脑的主机：“主机没有被破坏，但硬盘好像被拆走了——看来有人比我们先一步找到这里，拿走了硬盘。”
“那怎么办？CG文件肯定在硬盘里，现在硬盘被拿走了，我们岂不是白来了？”阿笠博士着急地说。
柯南却没有慌，他走到书架前，仔细翻看着散落的书：“板仓卓是个很谨慎的人，他肯定不会把重要的CG文件只存在硬盘里，说不定还有备份。你们看，这个书架的第三层，有一本书的厚度比其他书厚很多，里面可能藏着东西。”
夜一走过去，拿起那本书——是一本《CG制作大全》，他打开书，发现里面果然有一个夹层，夹层里放着一张光盘，上面写着“星空下的约定——备份”。
“找到了！”夜一兴奋地把光盘递给柯南，“这应该就是我们要找的CG文件备份！”
柯南接过光盘，刚想放进笔记本电脑里查看，突然听到门外传来脚步声。夜一立刻把光盘藏起来，示意柯南和阿笠博士躲到书架后面，自己则躲在门后，手里紧紧攥着电击枪。
脚步声越来越近，停在503房间门口。过了一会儿，门锁传来“咔哒”一声，门被打开了——进来的人竟然是赤井秀一！
赤井秀一走进房间，环顾了一圈，眼神锐利地扫过书架和电脑桌。他走到电脑前，检查了一下主机，然后又走到书架前，拿起那本《CG制作大全》，翻了翻，发现夹层是空的，眉头皱了起来。
躲在门后的夜一，紧紧盯着赤井秀一的动作，他的手放在电击枪的开关上，只要赤井秀一有异常动作，他就会立刻动手。
赤井秀一站在房间中央，沉默了几秒，突然开口：“出来吧，我知道你们在这里。”
柯南和阿笠博士对视一眼，刚想出来，夜一却按住了他们——他慢慢从门后走出来，手里的电击枪对准赤井秀一：“赤井先生，你为什么会在这里？你一直在跟踪我们？”
赤井秀一看到夜一，眼神里没有惊讶，反而露出一丝微笑：“工藤夜一，服部平藏的徒弟，没想到会在这里遇到你。我确实在跟踪你们，但不是为了伤害你们，而是为了保护你们——黑暗组织的人也在找这个工作室，刚才你们看到的黑色轿车，就是组织的人。”
“保护我们？”夜一怀疑地说，“你是FBI，为什么要保护我们？我们和你们FBI没有关系。”
“因为我们有共同的敌人——黑暗组织，”赤井秀一说，“我知道你们手里有板仓卓的日记磁片，也知道你们在找CG文件。我可以帮你们，但你们要告诉我，你们知道多少关于组织的事情。”
夜一没有立刻回答，他回头看了看柯南，眼神里带着询问。柯南从书架后面走出来，看着赤井秀一：“赤井先生，你真的是FBI？你有证据吗？”
赤井秀一从口袋里拿出一个黑色的证件，递给柯南：“这是我的FBI证件，上面有我的照片和编号，你们可以去查。我来日本，就是为了追查黑暗组织，尤其是琴酒和贝尔摩德。”
柯南接过证件，仔细看了看，确认是真的FBI证件。他把证件还给赤井秀一：“我们可以和你合作，但我们有条件——你不能强迫我们交出线索，而且所有行动都要和我们商量，不能单独行动。”
赤井秀一点点头：“没问题，我答应你们的条件。现在，我们得赶紧离开这里——组织的人可能随时会回来。”
四人刚走到门口，夜一突然停下脚步：“等等，我听到外面有脚步声，好像不止一个人。”
赤井秀一立刻拿出手枪（是FBI的合法配枪），示意大家躲到门后。脚步声越来越近，停在503房间门口，然后门被推开了——是两个穿着黑色风衣的男人，手里拿着枪，正是组织的成员！
“里面有人！”其中一个男人喊道，立刻举枪对准门后。
夜一反应最快，他一把推开赤井秀一，同时按下电击枪的开关，电击针射中了那个男人的胸口。男人哼了一声，倒在地上。另一个男人想开枪，赤井秀一却已经绕到他身后，一拳打在他的后颈，男人也倒了下去。
“快，把他们拖到里面，”赤井秀一说，“我们得赶紧离开，他们的同伙肯定就在附近。”
四人把两个组织成员拖到工作室的储藏室里，用绳子绑住他们的手脚，然后快速离开写字楼，从后门走进小巷。
“现在去哪里？”阿笠博士气喘吁吁地说，“我们手里有CG文件，组织的人肯定不会放过我们。”
“去我之前租的安全屋，”夜一说，“在米花町东街区，那里很隐蔽，组织的人找不到。”
四人按照夜一的指示，向安全屋走去。路上，赤井秀一告诉柯南和夜一，他已经调查黑暗组织很久了，知道组织的很多秘密