四谷吓得魂飞魄散，脸色惨白：“菊次，你别冲动！有话好好说！”
“放下刀！”工藤夜一站在菊次面前，眼神锐利，“你已经跑不掉了，警方马上就到！伤害人质只会让你的罪行更严重！”
菊次却不领情，挥舞着水果刀：“少废话！让我走，不然我就杀了他！”
就在这时，工藤夜一突然动了，他侧身躲开菊次的刀，同时伸出右手，抓住了菊次的手腕，用力一拧，菊次吃痛，水果刀掉在了地上。接着，工藤夜一又一脚踹在菊次的膝盖上，菊次跪倒在地，工藤夜一迅速拿出绳子，将菊次的双手反绑在身后，动作干净利落。
“搞定！”工藤夜一拍了拍手，“你以为你能跑得掉吗？”
四谷吓得瘫坐在地上，大口喘着气。小兰和灰原哀赶紧跑过去，安慰他：“你没事吧？别害怕，凶手已经被抓住了！”
五、真相大白：菊次的忏悔与案件的落幕
没过多久，目暮警官带着警员赶到了樱台公寓。看到被绑住的菊次和惊魂未定的四谷，目暮警官立刻安排警员将菊次控制住，同时让法医对四谷进行简单检查。
“毛利老弟，这次又是你们立了大功啊！”目暮警官拍着小五郎的肩膀，语气里满是赞许，“要不是你们，这四年前的焚尸案和工人自杀案，恐怕还得石沉大海！”
小五郎得意地挺起胸膛：“哪里哪里，都是我毛利小五郎的推理厉害！当然，也多亏了柯南和夜一、灰原的帮忙。”柯南在一旁无奈地翻了个白眼，心里默默吐槽：明明大部分推理都是我做的，结果又被你抢了功劳。
警员在菊次的房间里搜出了大量证据：制作女鬼影像的电脑、控制电视的万能遥控器、残留着费洛蒙药剂的喷雾瓶、装过酚酞和氨水的空瓶子，还有一本日记——日记里详细记录了他杀害佐藤雪和田原勇的经过。
“四年前，我因为投资失败，欠了一大笔钱，”菊次坐在审讯室里，头垂得很低，声音沙哑，“我知道佐藤雪研究的费洛蒙药剂很有价值，就想让她把研究成果卖给我，还向她借了50万。可她不仅不肯卖成果，还催我还钱，说要去法院告我……我一时冲动，就用花瓶砸晕了她，然后放火烧了她的房间，伪造成意外失火。”
“那田原勇呢？”目暮警官追问，“你为什么要杀他？”
菊次的身体颤抖了一下：“三个月前，旁边大楼施工，田原勇在工地里发现了我当年不小心遗落在现场的一块手表——那是我砸晕佐藤雪时，不小心掉在她房间里的，后来火灾现场清理时，被工人当成垃圾运到了工地。他拿着手表来问我，说觉得四年前的火灾不对劲，还说要去报警……我怕他暴露我的罪行，就把他骗到工地的仓库里，用绳子勒死了他，伪造成上吊自杀的样子。”
“你为了掩盖自己的罪行，竟然制造幽灵传说，吓跑其他住户，”目暮警官愤怒地说，“你知不知道，你的行为给多少人带来了恐惧？四谷先生因为你的恶作剧，整夜睡不着觉；番町先生吓得不敢在家上厕所；还有其他住户，因为害怕幽灵，都准备搬离公寓！”
菊次的眼泪流了下来：“我知道错了……我不该杀佐藤雪，不该杀田原勇，更不该制造幽灵传说吓唬大家……我现在后悔了，可是已经晚了……”
案件终于真相大白，佐藤雪的冤屈得以昭雪，田原勇的死因也水落石出。江崎家的人得知消息后，还特意给少年侦探团和工藤夜一、灰原哀送来了感谢信，感谢他们又破获了一起冤案。
几天后，樱台公寓恢复了往日的平静。四谷和番町不再害怕，其他住户也打消了搬离的念头。工藤夜一和灰原哀还特意去公寓里做了一次“科学普及”，告诉住户们之前的幽灵现象都是菊次用科学手段制造的假象，让大家彻底放下心来。
“夜一，灰原，谢谢你们！”四谷握着工藤夜一的手，感激地说，“现在我家孩子也不怕了，晚上能睡好觉了！”
番町也笑着说：“是啊，之前我总觉得厕所里有鬼，现在知道是菊次搞的鬼，再也不害怕了！以后要是再有什么怪事，我一定第一时间找你们帮忙！”
工藤夜一笑着说：“不用客气，这是我们应该做的。以后要是遇到什么问题，随时可以联系我们。”
离开公寓时，柯南看着楼里亮起的灯光，心里满是欣慰——又一起冤案得以昭雪，又一个罪犯受到了惩罚，这就是侦探工作的意义吧。
六、尾声：感冒痊愈与新的约定
小兰的感冒在几天后也痊愈了。为了庆祝小兰康复，也为了庆祝案件顺利解决，园子提议去吃烤肉。小五郎一听有烤肉吃，立刻举双手赞成，柯南、工藤夜一和灰原哀也没有反对。
烤肉店里，香气扑鼻。小五郎一边大口吃着烤肉，一边喝着啤酒，嘴里还念念有词：“还是烤肉好吃啊！下次要是再遇到案子，一定要再破一个大的，然后让别人请我吃更好的！”
小兰无奈地摇摇头：“爸爸，你就知道吃！不过这次真的要谢谢夜一和灰原，还有柯