柯南立刻跟了上去，对身后的众人小声说：“那个人的钱肯定有问题，我们跟着他，说不定能找到假钞团伙的窝点！”夜一立刻点头，示意大家保持距离，不要被发现。
男人沿着街道往前走，时不时回头张望，确认没人跟踪后，拐进了一条偏僻的小巷。柯南等人躲在巷口的拐角处，看着男人走进一栋破旧的居民楼。夜一拿出手机，悄悄拍下了居民楼的地址，然后对柯南说：“我们先回去报警，等警察来了再行动，这里太危险了。”
柯南点点头，刚要转身，就看到男人又从居民楼里走了出来，手里多了一个黑色的背包，他快步走向巷口，似乎要去什么地方。柯南当机立断：“我们跟上去，看看他要去哪里！”
众人跟着男人穿过几条街道，来到一个废弃的工厂门口。男人左右看了看，推开虚掩的大门走了进去。柯南等人躲在工厂外的草丛里，透过窗户看到里面有三个男人正在整理一叠叠的纸币，地上还放着几台印刷机——这里果然是假钞团伙的窝点！
夜一立刻用手机拨打了报警电话，向警方说明情况和地址。没过多久，警车就呼啸而至，警察们冲进工厂，将正在制作假钞的团伙一网打尽。那个在便利店使用假钞的男人也被当场抓获，他看着突然出现的警察和少年侦探团，脸色惨白，再也没有了之前的嚣张。
解决了假钞事件后，众人送俊也回家。在路上，灰原突然停下脚步，对柯南说：“柯南，我有话要跟你说，关于黑衣组织的事情。”
柯南和夜一都愣住了，他们没想到灰原会突然提起这个。三人走到路边的公园长椅上坐下，元太、光彦和步美则在不远处的滑梯旁玩耍。
灰原看着地面，声音很轻，却带着不容置疑的认真：“柯南，你其实就是工藤新一吧？你被黑衣组织灌下的药物，名叫APTX4869，而研制这种药物的人，就是我。”
柯南的身体瞬间僵住，他瞪大了眼睛看着灰原，不敢相信自己听到的话：“你……你说什么？APTX4869是你研制的？”
“没错。”灰原抬起头，眼底带着一丝痛苦和愧疚，“我原本是黑衣组织的成员，代号‘雪莉’，负责药物研发。我姐姐宫野明美因为反抗组织，被琴酒杀害，我为了替姐姐报仇，故意销毁了部分药物资料，结果被组织囚禁起来。后来我吞下了APTX4869，身体缩小，才从组织里逃了出来，被阿笠博士收留。”
夜一坐在旁边，脸色也变得严肃起来：“所以，俊也提到的黑衣女人，会不会就是组织的人？他们找夏目漱石的肖像画，是不是和药物资料有关？”
灰原摇了摇头：“不确定，但组织一直在寻找和药物相关的资料，我之前销毁的只是一部分，还有一些资料散落在外面。我记得有一位名叫广田正巳的教授，他曾经和我一起研究过APTX4869，手里有一张保存着重要资料的软盘，说不定组织已经盯上他了。”
柯南立刻站起身：“我们必须尽快找到广田教授，不能让软盘落入组织手里！”他拿出手机，拨通了阿笠博士的电话，“博士，你知道广田正巳教授的地址吗？我们有很重要的事情找他！”
阿笠博士很快就发来了地址，三人立刻告别元太等人，坐上出租车往广田教授家赶去。路上，柯南看着灰原，轻声说：“对不起，之前一直不知道你的经历……”
灰原摇摇头，嘴角露出一丝淡淡的笑容：“没关系，现在我们是同伴，不是吗？”夜一看着两人，轻轻点了点头——从今天起，他们又多了一个共同的目标，那就是对抗黑衣组织，保护彼此。
出租车停在一栋白色的小楼前，这里就是广田教授的家。柯南按了按门铃，却没有人应答。阿笠博士也赶到了，他皱着眉头说：“我刚才给教授打电话，一直没人接，不会出什么事吧？”
夜一试着推了推大门，发现门没有锁，他轻轻推开一条缝，小声说：“里面好像没人，我们进去看看。”
四人走进客厅，一股奇怪的味道扑面而来。客厅里一片狼藉，电话掉在地上，书散落得到处都是，一副西洋棋被打翻在茶几上，棋子滚得满地都是。最让人触目惊心的是，客厅角落的柜子倒在地上，柜子下面似乎压着什么东西。
柯南快步走过去，小心翼翼地掀开柜子，发现广田教授躺在地上，脸色苍白，已经没有了呼吸。阿笠博士立刻拨打了急救电话和报警电话，声音带着颤抖：“教授……他已经死了……”
灰原站在原地，看着倒在地上的广田教授，眼底满是震惊和悲伤——这是又一个因为APTX4869而失去生命的人，而她，就是药物的研制者。夜一走到她身边，轻轻拍了拍她的肩膀，无声地安慰着她。
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很快，目暮警官带着高木涉和佐藤美和子赶到了现场。经过法医初步检查，广田教授的死因是头部受到重击，而重击他的正是倒下的柜子，死亡时间大概在昨天晚上7点到9点之间。